基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)學(xué)科是山西省唯一的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士學(xué)位授權(quán)點，擁有省內(nèi)最優(yōu)秀的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)科研團隊,，長期以來一直開展基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)理論和應(yīng)用研究,，圍繞食管癌發(fā)生機理,、心肌缺血性疾病、肝臟纖維化、糖尿病、心腦血管病藥物、干細胞等方向開展研究,。目前形成了人體生理與病理生理學(xué)、再生醫(yī)學(xué),、病理學(xué),、人體解剖與組織胚胎學(xué)、基礎(chǔ)藥理與分子藥理學(xué),、醫(yī)學(xué)信息學(xué)等六個穩(wěn)定的研究方向,。

2016年以來學(xué)科主持國家級科研項目48項、省部級科研項目163項,，發(fā)表SCI論文325篇,，專利83項，獲得省部級科研成果獎16項,。公開發(fā)表的學(xué)術(shù)論文中,，圍繞神經(jīng)退行性疾病藥物治療的機制研究、代謝紊亂相關(guān)心血管疾病的多種機制研究,、心肌再生的基礎(chǔ)與臨床研究,、食管鱗癌遺傳變異的分析鑒定及癌變機制研究、健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用及精準醫(yī)學(xué)等研究領(lǐng)域,，形成了多篇標志性學(xué)術(shù)成果,。其中以國家百千萬工程人選、教育部“新世紀優(yōu)秀人才”,、山西省青年三晉學(xué)者、“三晉英才”高端領(lǐng)軍人才崔永萍教授帶領(lǐng)的團隊,，依托“食管癌發(fā)病機理及轉(zhuǎn)化研究”山西省重點實驗室和山西省科技創(chuàng)新重點團隊,，圍繞我國特色、山西高發(fā)的食管鱗癌,，聚焦于食管鱗癌早篩,、早診標記物和食管癌驅(qū)動基因作用網(wǎng)絡(luò)研究方向，利用多組學(xué),、細胞生物學(xué)和分子生物學(xué)技術(shù)與手段,，在食管癌發(fā)生發(fā)展中關(guān)鍵基因的作用及其功能研究基礎(chǔ)上，取得了系列原創(chuàng)成果,。據(jù)Web of Science數(shù)據(jù),，近五年在全球食管癌遺傳變異分析領(lǐng)域最有影響力的人員中，本學(xué)科貢獻達17%,，排名第5,。

學(xué)科于2016年獲批國家級實驗教學(xué)示范中心，成為區(qū)域一流的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教學(xué)和研究平臺。另外為了滿足科研需求,，于2019年底在中都校區(qū)建成占地8000平米的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中心為學(xué)科的未來發(fā)展提供了有力支撐,。