我校曹濟(jì)民教授團(tuán)隊(duì)在一區(qū)top期刊《International Journal of Biological Macromolecules》連發(fā)兩篇結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究論文
稿件來(lái)源:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院 發(fā)布時(shí)間:2025-01-09 點(diǎn)擊次數(shù):
近日,我校生理學(xué)系/細(xì)胞生理學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室曹濟(jì)民教授團(tuán)隊(duì)在中國(guó)科學(xué)院一區(qū)top期刊《International Journal of Biological Macromolecules》(IJBM)連續(xù)發(fā)表了題為“Crystal structure of F10 core protein from Mpox virus reveals its potential inhibitors”(2025 Jan; 284(Pt 1):138079. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2024.138079)和“Structure-based discovery of dual-target inhibitors of the helicase from Bagaza virus”(2025 Jan 5, online ahead of print. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.139536)的兩篇研究論文,分別成功解析了猴痘病毒F10核心蛋白和巴加扎病毒解旋酶的晶體結(jié)構(gòu),,并依據(jù)蛋白結(jié)構(gòu),篩選出了相關(guān)抗病毒藥物,。IJBM為生物大分子研究領(lǐng)域的經(jīng)典國(guó)際期刊,目前為中國(guó)科學(xué)院一區(qū)top期刊,,IF=7.7,。在這兩篇論文中,,博士研究生趙蓉均為第一作者,,曹濟(jì)民教授、周鑫教授和王德平教授為共同通訊作者,。
1. 猴痘病毒(MPXV)F10核心蛋白的結(jié)構(gòu)解析及抑制劑篩選,。MPXV是痘病毒科的一種DNA病毒,感染人體后引起猴痘,。猴痘具有很高的傳染性,,并有一定的致死性,但尚無(wú)有效治療藥物。目前已報(bào)告了15600多例人猴痘病例和537例死亡病例,。MPXV的RNA聚合酶(RNAP)由RNAP核心酶和病毒早期轉(zhuǎn)錄因子(VETF),、核苷三磷酸磷酸水解酶(NPH-I)、RNA聚合酶相關(guān)蛋白(Rap94)和F10核心蛋白等因子組成,,負(fù)責(zé)猴痘DNA的早期轉(zhuǎn)錄,。二聚體F10核心蛋白可穩(wěn)定Rap94的N端區(qū)域和NPH-I的C端結(jié)構(gòu)域,從而增強(qiáng)RNAP復(fù)合物的穩(wěn)定性,。該工作以1.5 Å的高分辨率解析了F10核心蛋白的晶體結(jié)構(gòu),,并將MPXV F10核心蛋白與已解析的痘苗病毒(VACV) RNAP的結(jié)構(gòu)進(jìn)行比對(duì),確定了F10核心蛋白與NPH-I結(jié)合的空腔,。針對(duì)該空腔進(jìn)行了靶向F10核心蛋白的抗病毒藥物虛擬篩選,,發(fā)現(xiàn)28種化合物可作為潛在的MPXV抑制劑,首次篩選了靶向RNAP的抗MPXV藥物,,該研究提供了一種開(kāi)發(fā)抗猴痘藥物的新技術(shù)路徑,。
圖 1. MPXV F10在RNAP中的作用機(jī)制及針對(duì)F10篩選MPXV抑制劑的策略
2. 巴加扎病毒(BAGV)解旋酶(helicase)的晶體結(jié)構(gòu)解析及抑制劑篩選。BAGV是一種黃病毒,,以蚊蟲(chóng)為傳播媒介,,不僅引起了嚴(yán)重的禽類(lèi)死亡,人體感染后還會(huì)引起腦炎,。BAGV基因組編碼10種蛋白,,包括3種結(jié)構(gòu)蛋白和7種非結(jié)構(gòu)蛋白。BAGV的NS3蛋白的C端在BAGV復(fù)制過(guò)程中起解旋酶的作用,,利用ATP水解能量將病毒RNA雙鏈解開(kāi)以幫助病毒進(jìn)一步復(fù)制,。該工作解析了BAGV helicase的晶體結(jié)構(gòu),揭示了該helicase中的NTP和RNA結(jié)合口袋,,可作為抗BAGV藥物的靶點(diǎn),。基于該解旋酶的晶體結(jié)構(gòu),,通過(guò)虛擬篩選,,發(fā)現(xiàn)了20種同時(shí)靶向NTP結(jié)合位點(diǎn)和RNA結(jié)合位點(diǎn)的化合物。并通過(guò)分子對(duì)接,、氨基酸突變分析,、等溫滴定量熱法(ITC)和ATP酶活檢測(cè),發(fā)現(xiàn)EGCG,、Quercitrin,、Citicoline sodium及Isochlorogenic acid C對(duì)BAGV解旋酶的雙靶點(diǎn)的親和力高,并能明顯抑制ATP酶的活性,,因而這四種化合物可能是最有前景的BAGV抑制劑,。該工作的亮點(diǎn)是發(fā)現(xiàn)了BAGV helicase的雙靶點(diǎn)抑制劑,這為推進(jìn)針對(duì)BAGV以及其他黃病毒的創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)提供了新的策略。
圖2. 基于BAGV helicase結(jié)構(gòu)的虛擬篩選和分子對(duì)接發(fā)現(xiàn)BAGV的雙靶點(diǎn)抑制劑
(圖文/趙蓉)
復(fù)審復(fù)校:王卓
終審終校:侯小寶