生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)肝細(xì)胞肝癌診療新靶點(diǎn)——范益民課題組研究成果在權(quán)威學(xué)術(shù)期刊發(fā)表
據(jù)2020全球腫瘤流行病統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)（GLOBOCAN 2020）估計(jì)，全世界肝癌新發(fā)病例約90.57萬(wàn)，死亡病例約83.02萬(wàn)，居惡性腫瘤發(fā)病率第6位，死亡率第3位。其中，中國(guó)人群肝癌新發(fā)病例和死亡病例分別占全世界的45.27%和47.12%。雖然肝癌的治療手段包括手術(shù)切除、肝移植、介入治療、靶向治療及免疫治療等多種形式，但患者預(yù)后仍不能令人滿意。
生物信息學(xué)對(duì)于現(xiàn)代生物學(xué)和醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)的分析具有重大意義，其研究成果將對(duì)人類社會(huì)和經(jīng)濟(jì)產(chǎn)生巨大推動(dòng)作用。通過(guò)生物信息學(xué)的方法，對(duì)基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)，微生物組學(xué)，表觀遺傳學(xué)，代謝組學(xué)，免疫組學(xué)等各種不同的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，對(duì)疾病機(jī)制機(jī)理研究，相關(guān)基因的發(fā)現(xiàn)，藥物靶點(diǎn)分析，藥物發(fā)現(xiàn)，以及疾病的個(gè)性化治療提供了新的見解與解決方案。
近日，山西醫(yī)科大學(xué)第一醫(yī)院范益民教授團(tuán)隊(duì)通過(guò)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，PDZ-binding kinase (PBK)在肝細(xì)胞肝癌患者體內(nèi)表達(dá)明顯增高，且與患者不良預(yù)后及免疫治療密切相關(guān)，PBK可作為肝細(xì)胞肝癌預(yù)后不良的生物標(biāo)志物和潛在的免疫治療靶點(diǎn)。該研究結(jié)果以題為“High expression of PDZ-binding kinase is correlated with poor prognosis and immune infiltrates in hepatocellular carcinoma”的研究報(bào)告在《World Journal of Surgical Oncology》在線發(fā)表。課題組博士研究生慕偉為該論文的第一作者，課題組負(fù)責(zé)
人范益民教授為通訊作者。
該研究經(jīng)過(guò)多個(gè)獨(dú)立數(shù)據(jù)庫(kù)證實(shí)，PBK在肝細(xì)胞肝癌組織中表達(dá)極高，且PBK高表達(dá)組患者的預(yù)后較差，是影響患者預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。另外，本研究首次分析了PBK的表達(dá)與肝細(xì)胞肝癌患者臨床病理特征的關(guān)系，首次通過(guò)ROC曲線確定了PBK在肝細(xì)胞肝癌患者中的診斷價(jià)值，特別是首次報(bào)道了PBK的表達(dá)與腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞、趨化因子和受體之間的相關(guān)性。這些研究結(jié)果有助于我們建立以PBK為核心的肝細(xì)胞肝癌診療研究方向，為我們后續(xù)研究做理論基礎(chǔ)。
部分研究數(shù)據(jù)和圖示
